У відповідь на пандемію коронавірусу NVIDIA запропонувала озброїтися інструментами, покликаними зрозуміти природу Covid-19 і знайти йому ефективну протидію. В даний час компанія безкоштовно надає 90-денну ліцензію на Parabricks всім дослідникам нового коронавірусу.
Програмне забезпечення Parabricks із секвенування геному засноване на популярному наборі інструментів Genome Analysis і працює на базі GPU, прискорюючи аналіз даних у секвенціях до 50 разів. NVIDIA стежить за ситуацією і висловила готовність продовжувати доступ у міру необхідності. Всі, хто мають доступ до графічних процесорів NVIDIA, можуть заповнити форму і отримати ліцензію на Parabricks.
Зараз дослідники секвенують як геном коронавірусу, так і геноми людей, хворих Covid-19, щоб зрозуміти, як поширюється хвороба і кого вона зачіпає в першу чергу. Однак аналіз послідовностей геномів займає багато часу і вимагає істотних обчислювальних ресурсів.
Команда Parabricks увійшла до складу NVIDIA в грудні 2019 року, доповнивши існуючий інструментарій NVIDIA новітніми розробками в галузі секвенування геному. Інструменти Parabriks допомагають скоротити час визначення варіантів геному людини від днів до години всього на одному сервері. Враховуючи безпрецедентну швидкість розвитку пандемії, швидке отримання результатів допоможе швидше зрозуміти еволюцію вірусу для створення ефективних вакцин.
Зараз NVIDIA також обмірковує можливість надання обчислювальних ресурсів і доступу до Parabricks на платформах провайдерів хмарних сервісів і суперкомп'ютерних центрів.
Також компанія зазначила, що для дослідників, які працюють з секвенуванням з тривалим зчитуванням Oxford Nanopore, на GitHub доступний репозитарій інструментів, прискорюваних на GPU. Прискорення на графічних процесорах NVIDIA також підтримують такі програми, як Medaka, Racon, Raven, , .ReticulatusUnicycler
